Алтайский агротехнический техникум был основан в 1971 г с. Троицкое, Троицкого района, Алтайского края на базе сельского профессионально-технического училища №26. Первоначальное название учебного заведения - Алтайский индустриально-педагогический техникум.

В техникуме осуществлялась подготовка мастеров производственного обучения для сельских профессиональных училищ Алтайского края и Западной Сибири. В 1993 г. техникум преобразован в колледж, в 1998 г. получил название Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж.

В конце 1990-х - начале 2000-х гг. колледж стал развиваться как многопрофильное учебное заведение с многоступенчатой системой подготовки и переподготовки кадров. Колледжу удалось расширить перечень специальностей, сохранив при этом свою изначальную сельскохозяйственную специфику.

1 июля 2014 года учебному заведению присвоено новое название - КГБПОУ "Троицкий агротехнический техникум".

30 июля 2018 года  учебному заведению присвоено новое название - КГБПОУ "Алтайский агротехнический техникум" 

Приказом Министерства образования Российской Федерации от 13.07.1993г. №290 Алтайский индустриально-педагогический техникум переименован в Алтайский индустриально-педагогический колледж. 

Приказом Министерства общего и профессионального образования Российской Федерации от 22.05.1998г. № 1306 Алтайский индустриально-педагогический колледж переименован в Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж. 

Приказом Федерального агентства по образованию от 25.01.2002г. №45 Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж переименован в государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж». 

Приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 27.09.2011г. №2398 государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж» переименовано в федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж». 

Постановлением Администрации Алтайского края от 30.12.2011г. №788 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж» переименовано в краевое государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж». 

Постановлением Администрации Алтайского края от 14.05.2014г. №234 краевое государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Алтайский государственный профессионально-педагогический колледж» реорганизовано в форме присоединения к нему краевого государственного бюджетного образовательного учреждения начального профессионального образования «Профессиональное училище № 58» и переименовано в краевое государственное бюджетное профессиональное образовательное учреждение «Троицкий агротехнический техникум».

 Постановлением Правительства Алтайского края от 28.03.2018г. №104 краевое государственное бюджетное профессиональное образовательное учреждение «Троицкий агротехнический техникум» реорганизовано в форме присоединения к нему краевого государственного бюджетного профессионального образовательного учреждения «Косихинский лицей профессионального образования» и переименовано в краевое государственное бюджетное профессиональное образовательное учреждение «Алтайский агротехнический техникум».